křesťanství bylo založeno v Nigérii příchodem misionáře Wesleyanské metodistické církve v roce 1842. Přišel v reakci na žádost misionářů bývalými otroky, kteří se vrátili do Nigérie ze Sierry Leone. Z misijních stanic zřízených v Badagry a Abeokuta, metodistická církev se rozšířila do různých částí země západně od řeky Niger a části severu. V roce 1893 přišli misionáři primitivní metodistické církve z Fernanda Po, ostrova u jižního pobřeží Nigérie. Odtud se metodistická církev rozšířila do dalších částí země, východně od řeky Niger a také do částí severu. Kostel západně od řeky Niger a část severu byl známý jako okres Západní Nigérie a východně od Nigeru a další část severu jako Okres Východní Nigérie. Oba existovali nezávisle na sobě až do roku 1962, kdy představovali konferenci metodistické církve Nigérie. Konference se skládá ze sedmi okresů. Církev se nadále rozšířila do nových oblastí a zřídila oddělení pro dosah / evan-gelismus a jmenovala ředitele evangelizace. Biskupský systém přijatý v roce 1976 nebyl plně přijat všemi částmi církve, dokud se obě strany neshodly a nerozhodly se ukončit nesouhlas. V roce 1990 byla ratifikována nová ústava. Systém je stále biskupský, ale body, které způsobily nespokojenost, byly změněny tak, aby byly přijatelné pro obě strany.
metodistická církev Nigérie (MCN) byla v čele duchovní a sociální transformace šířením duchovní svatosti a investováním do zdravotnických a zdravotnických služeb a sociálně-ekonomického blahobytu lidí. Církev zřídila různé instituce, jako je centrum lepry, tři Centra pro duševně nemocné a sirotčince pro děti osiřelé HIV / AIDS. Tato centra oslovují odmítnuté a méně privilegované členy společnosti. Zajišťují také opětovné začlenění těch, kteří byli dříve považováni za vyvrhele a byli vystaveni různým společenským zneužíváním. V oblasti zdraví MCN založil nemocnici Wesley Guild Hospital a několik metodistických nemocnic rozmístěných po celé zemi, které poskytují dobré zdravotnické služby ve svém prostředí. Kromě všech ostatních služeb MCN Od počátku kladla velmi silný důraz na potřebu vzdělávání. Po celé zemi církev zřídila četné školy, od mateřských škol přes základní až po vyšší střední školy a teologické instituce, které vytvořily muže a ženy, kteří přispěli a stále velmi významně přispívají do všech sfér lidského úsilí. Nyní bylo rozhodnuto o založení Wesley University of Science and Technology (WUSTO)v Ondo, jihozápadní oblasti Nigérie, se satelitními kampusy v šesti geopolitických zónách země.
metodistická církev Nigérie je vedena prelátem, který předsedá konferenci, celkovému řídícímu orgánu církve. Tato konference se schází každé dva roky, aby zvážila a přijala rozhodnutí o všech otázkách ovlivňujících život církve. Konferenční prostor je rozdělen do osmi arcidiecézí. Každá arcidiecéze se skládá z nejméně čtyř diecézí, kterým arcibiskup předsedá na zasedáních Arcidiecézní rady. Existují 44 diecéze, každá se skládá z několika okruhů a v čele s biskupem, který předsedá výroční synodě. Ústava církve stanoví laickou účast na vedení církve od místní církve až po konferenční úroveň.