het christendom werd opgericht in Nigeria met de komst in 1842 van een Wesleyan Methodist Church Missionaris. Hij was gekomen in antwoord op het verzoek om Missionarissen van de ex-slaven die vanuit Sierra Leone naar Nigeria terugkeerden. Vanuit de missieposten in Badagry en Abeokuta, verspreidde de Methodistische Kerk zich over verschillende delen van het land ten westen van de rivier de Niger en een deel van het noorden. In 1893 arriveerden Missionarissen van de primitieve Methodistische Kerk van Fernando Po, een eiland voor de zuidkust van Nigeria. Van daaruit verspreidde de Methodistische Kerk zich naar andere delen van het land, ten oosten van de rivier de Niger en ook naar delen van het noorden. De kerk ten westen van de rivier de Niger en een deel van het noorden stond bekend als het District West-Nigeria en ten oosten van de Niger en een ander deel van het noorden als het District Oost-Nigeria. Beide bestonden onafhankelijk van elkaar tot 1962, toen ze de Conferentie van Methodist Church Nigeria vormden. De conferentie bestaat uit zeven districten. De kerk is blijven verspreiden naar nieuwe gebieden en heeft een afdeling voor outreach/evan-gelism opgericht en een directeur evangelisatie benoemd. Een bisschoppelijk systeem dat in 1976 werd aangenomen werd niet volledig aanvaard door alle afdelingen van de kerk totdat de twee partijen bij elkaar kwamen en besloten om het meningsverschil te beëindigen. In 1990 werd een nieuwe grondwet geratificeerd. Het systeem is nog steeds bisschoppelijk, maar de punten die tot ontevredenheid hebben geleid, zijn voor beide partijen aanvaardbaar. De Methodist Church Nigeria (MCN) heeft een voortrekkersrol gespeeld op het gebied van spirituele en sociale transformatie, door spirituele heiligheid te verspreiden en te investeren in medisch-gezondheidsdiensten en sociaal-economisch welzijn van de mensen. De kerk heeft verschillende instellingen opgericht, zoals het lepracentrum, drie centra voor geesteszieken en een weeshuis, voor kinderen die wees zijn door HIV/AIDS. Deze centra reiken uit naar de afgewezen en minder bevoorrechte leden van de samenleving. Zij zorgen ook voor de reïntegratie van degenen die voorheen als uitgestotenen werden behandeld en die het slachtoffer waren van verschillende maatschappelijke misstanden. Op het gebied van gezondheid MCN heeft het Wesley Guild Hospital en een aantal Methodist ziekenhuizen verspreid over het land die goede gezondheidszorg diensten in hun omgeving. Naast alle andere diensten heeft MCN vanaf het begin sterk de nadruk gelegd op de behoefte aan onderwijs. In het hele land heeft de kerk talrijke scholen opgericht, van de kleuterschool tot de lagere tot de hogere middelbare scholen en theologische instellingen die mannen en vrouwen hebben voortgebracht die hebben bijgedragen en nog steeds een zeer belangrijke bijdrage leveren aan alle gebieden van de menselijke inspanning. Het besluit is nu genomen om de Wesley University of Science and Technology (WUSTO) op te richten in Ondo, zuidwestelijke gebied van Nigeria, met satellietcampussen in de zes geo-politieke zones van het land.
de Methodist Church Nigeria wordt geleid door de prelaat, die de conferentie voorzit, het algemene bestuursorgaan van de kerk. Deze conferentie komt om de twee jaar bijeen om te beraadslagen en beslissingen te nemen over alle kwesties die van invloed zijn op het leven van de kerk. Het conferentiegebied is verdeeld in acht archdiocesen. Elk aartsbisdom bestaat uit niet minder dan vier bisdommen waarover een aartsbisschop de vergaderingen van de archdiocesane Raad voorzit. Er zijn 44 bisdommen, elk bestaande uit een aantal circuits en geleid door een bisschop die de jaarlijkse synode voorzit. De constitutie van de kerk voorziet in de deelname van leken aan de leiding van de kerk van de lokale kerk tot het niveau van de conferentie.